技術服務

a. 工具簡介

ImageStudio是(shì)時(shí)空組學線下圖像處理軟件，主要(yào / yāo)涉及圖像質量評估和(hé / huò)圖像手動調整模塊（圖像拼接、組織分割和(hé / huò)細胞分割）。圖像質量評估主要(yào / yāo)從圖像清晰度和(hé / huò)圖像track線兩個(gè)評估指标對顯微鏡拍攝的(de)圖像進行評分，用于(yú)判斷是(shì)否滿足下遊的(de)數據分析。圖像的(de)手動調整模塊，主要(yào / yāo)針對自動的(de)拼接或者分割算法無法滿足的(de)場景，借助手動工具對圖像進行處理。

b. 功能介紹

1. 圖像質控

圖像質控模塊主要(yào / yāo)評估時(shí)空組學項目中顯微鏡的(de)圖像質量是(shì)否滿足後續數據分析的(de)需求。圖像質控模塊主要(yào / yāo)包含："ssDNA/DAPI"和(hé / huò) DAPI&mIF 圖像QC、TIFF/PNG格式的(de)圖片上(shàng)傳及配置數據上(shàng)傳方式三大(dà)功能。

2. 圖像拼接

圖像拼接模塊基于(yú)芯片自身Track線，用于(yú)手動調整顯微鏡小圖的(de)拼接效果，輸入文件應爲(wéi / wèi)圖像QC結果爲(wéi / wèi)PASS的(de)顯微鏡小圖文件。

3. 圖像校準

圖像校準模塊用于(yú)手動調整 mIF 中蛋白與 DAPI 的(de)校準，主要(yào / yāo)從水平和(hé / huò)垂直方向。輸入文件爲(wéi / wèi) DAPI&mIF 圖像 QC 後的(de)數據。

4. 組織分割

組織分割模塊用于(yú)手動調整分割後的(de)組織mask。