産品中心

産品簡介

爲(wéi / wèi)解決作物在(zài)雜交育種中的(de)早期材料選育效率低，以(yǐ)及現有基因組預測模型泛化能力低的(de)問題，智數生物在(zài)海南省種業實驗室揭榜挂帥項目的(de)支持下，基于(yú)農業大(dà)數據，開發了(le／liǎo)智能育種決策輔助系統（BGI智能育種系統）。在(zài)系統使用方面，智數生物已将該系統部署在(zài)崖州灣科技城先進計算中心上(shàng)，育種家可通過訪問網站（http://59.50.39.12:8090/），創建育種項目，上(shàng)傳相關基因型-表型數據，在(zài)網頁上(shàng)實現表型預測、育種材料篩選。BGI智能育種系統由4個(gè)分析平台，1個(gè)種質資源數據庫組成。

其中，以(yǐ)全基因組選擇平台爲(wéi / wèi)核心，對目标表型進行預測；以(yǐ)育種表型數據管理平台、基因型數據分析平台爲(wéi / wèi)輔助，對育種材料進行統計分析、群體遺傳結構分析等工作；以(yǐ)雜交模拟平台爲(wéi / wèi)特色，對雜交群體的(de)親本組配方式進行優選；以(yǐ)種質資源數據庫爲(wéi / wèi)基礎，對系統内置的(de)基因組預測模型進行前期訓練工作。

全基因組選擇平台内置了(le／liǎo)10個(gè)經典模型，以(yǐ)及1個(gè)基因組預測AI模型，并将該模型命名爲(wéi / wèi)DeepGxE。同時(shí)，該模型也(yě)是(shì)本平台的(de)第一(yī / yì ／yí)個(gè)創新點。該模型建立基于(yú)環境型和(hé / huò)基因型數據，且使用GPU加速計算過程。在(zài)多個(gè)作物上(shàng)對該模型進行基準測試，結果表明，與經典的(de)基因組預測模型比較，該模型運行速度更快、預測性能更高、泛化性能更高。此外，該模型可用于(yú)兩類環境型數據：一(yī / yì ／yí)類是(shì)簡易的(de)數據，取時(shí)間、地(dì / de)點作爲(wéi / wèi)環境型數據，适用于(yú)多年多點；另一(yī / yì ／yí)類是(shì)詳細的(de)氣候數據、地(dì / de)理位置數據，如每天的(de)溫度、濕度等。本平台的(de)第二個(gè)創新點是(shì)集成了(le／liǎo)現有經典的(de)基因組預測模型，可供育種家靈活選擇，自主訓練。

産品服務

智數生物結合南繁育種基地(dì / de)的(de)技術優勢、材料優勢、測試點優勢，利用自主建設的(de)一(yī / yì ／yí)流測序平台，以(yǐ)及優秀的(de)生物信息技術團隊、人(rén)工智能團隊，建立結合“AI預測+育種經驗”的(de)智能育種決策輔助系統，爲(wéi / wèi)育種家提供優質的(de)智能育種服務。我們願與相關育種企業合作，開展大(dà)數據智能育種的(de)合作，充分發揮BGI智能育種系統的(de)優勢，建立育種賬号，開展全基因組選擇育種的(de)合作，并可提供育種材料的(de)測序服務、基因分型服務（如液相芯片捕獲試劑盒開發、多重PCR試劑盒開發、少量位點的(de)基因分型等）、個(gè)性化生物信息分析（如全基因組關聯分析、轉錄組分析等），高通量基因編輯服務，力争在(zài)3到(dào)5年内共同打造優質新品種，完成産業轉化，實現收益共享。